El Rector de la Universidad Privada Antenor Orrego, Dr. Víctor Raúl Lozano Ibáñez, supervisa, coordina y dirige el funcionamiento académico y administrativo. Para su funcionamiento operativo cuenta con el apoyo de la Secretaría General, así como de los órganos de asesoría. También coordina directamente la labor de los departamentos de Imagen Institucional y Sistemas e Ingeniería de Información. Además están adscritos al Rectorado las comisiones especiales como son la Oficina de Calidad y Acreditación(OCA) y la Comisión Asesora en Infraestructura y Desarrollo. El Rector, asimismo, ha asumido la supervisión de los programas UPAO Virtual, Radio Estación UPAO y el Fundo UPAO II. Asimismo, lidera personalmente la conducción de proyectos específicos como son implementación de la Plataforma de Gestión del Conocimiento, Google-Apps y redes sociales UPAO, entre otros. Conforme al Artículo 149 del Estatuto de la Universidad, el Rector es su personero y representante legal y le competen las siguientes atribuciones y obligaciones: