El Museo de Historia Natural de la UPAO inició sus actividades como Herbario el 27 de febrero de 1990; es decir, poco después de haber sido fundada la universidad. Al año siguiente, en 1991, se abrió al público la primera sala de exhibición. A partir de entonces, se vienen desarrollando las actividades de investigación y las colecciones, en cooperación con diversas instituciones científicas. Adicionalmente a las colecciones de flora y fauna, se ha formado la colección arqueológica, al igual que los principales museos de Historia Natural en el mundo.
MISIÓN Colectar, estudiar, conservar y exhibir muestras representativas del diverso patrimonio natural y cultural del Perú, en especial del norte del país; con el fin de generar y difundir conocimiento científico, así como impulsar la valoración y preservación del ambiente en que vivimos.
VISIÓN Ser reconocido a nivel nacional e internacional por sus actividades de investigación y educación relacionadas a la diversidad biológica y cultural de nuestro país.